সেশনজটের কবলে পড়েছেন জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয়ের অধিকাংশ বিভাগের শিক্ষার্থীরা। বিশ্ববিদ্যালয়ে এখন ৩৬টি বিভাগের শিক্ষা কার্যক্রম চলছে। এর মধ্যে অন্তত ২২টি বিভাগে ছয় মাস থেকে দেড় বছর পর্যন্ত সেশনজট রয়েছে বলে পরীক্ষা নিয়ন্ত্রকের দপ্তর সূত্রে জানা গেছে।