যাত্রীদের কাছ থেকে আদায় শুরু না হলেও মেট্রোরেলের ভাড়ায় ভ্যাটমুক্ত সুবিধা প্রত্যাহার করে নিয়েছে জাতীয় রাজস্ব বোর্ড-এনবিআর। তবে ভাড়ার ওপর এই টাকা কীভাবে আদায় হবে, তা নিয়ে এখন পর্যন্ত বুঝে উঠতে পারছে না তদারক সংস্থা ঢাকা ম্যাস ট্রানজিট কোম্পানি (ডিএমটিসিএল)।
ভ্যাট আদায় হলে কীভাবে নেওয়া হবে, সে বিষয়ে আগামী ৪ জুলাই এনবিআরের সঙ্গে বসতে যাচ্ছে সড়ক পরিবহন ও সেতু মন্ত্রণালয়। ডিএমটিসিএল এই মন্ত্রণালয়েরই অধীন।