অবৈধ ও অনিবন্ধিত নৌযানের কারণে বিভিন্ন সময়ে নদী পথে ঘটছে দুর্ঘটনা। এতে প্রাণহানির সংখ্যাও কম নয়। নিবন্ধনের আওতায় এনে যথাযথ নজরদারি থাকলে এসব দুর্ঘটনা অনেকাংশে কমবে বলে মনে করেন নৌযান সংশ্লিষ্টরা। নদীপথে এসব কার্যক্রম দেখভালের দায়িত্ব সরকারের দুই সংস্থা- বাংলাদেশ অভ্যন্তরীণ নৌ পরিবহন কর্তৃপক্ষ (বিআইডব্লিউটিএ) ও নৌ পরিবহন অধিদফতরের।