অর্থ মন্ত্রণালয় প্রকাশিত চূড়ান্ত হিসাবে দেখা যায়, এনবিআরের দেখানো রাজস্ব আদায়ের চেয়ে আরও কম টাকা আদায় হয়েছে। তাই প্রশ্ন উঠেছে, এনবিআরের আয় আসলে কত? এনবিআরের হিসাবে এক রকম তথ্য, আবার অর্থ মন্ত্রণালয়ের তথ্যে ভিন্ন রকম। এনবিআরের রাজস্ব আদায় নিয়ে প্রতিবছরই শত শত কোটি টাকার পার্থক্য থাকে।