হবিগঞ্জে মোট সরকারি প্রাথমিক বিদ্যালয় রয়েছে ১ হাজার ৫২টি। এর মধ্যে আট উপজেলার ২০৪টি বিদ্যালয়ের ভবনকে ঝুঁকিপূর্ণ ঘোষণা করেছে জেলা প্রাথমিক শিক্ষা অফিস। পরিত্যক্ত ঘোষণা করা হয়েছে আরো ছয়টি বিদ্যালয়ের