সে সময়ে ইস্কন কর্তৃপক্ষ জানিয়েছিলেন, চার দিকে বেড়ে চলা সংক্রমণের জেরেই মন্দির বন্ধ রাখার সিদ্ধান্ত নেওয়া হচ্ছে। তাই জন্মাষ্টমীর ক’দিন আগে অতিরিক্ত জনসমাগম এড়াতে ওই সিদ্ধান্ত নেওয়া হয়। দ্বিতীয় দফায় এক মাস বন্ধ থাকার পর মঙ্গলবার, ৮ সেপ্টেম্বর আবার মন্দিরের দরজা সকলের জন্য খুলে দেওয়া হল।
গত ২২ মার্চ থেকে লকডাউন পর্বে এক টানা ১০৩ দিন বন্ধ ছিল নদিয়া তথা রাজ্যের পর্যটক আকর্ষণের অন্যতম কেন্দ্র নদিয়ার মায়াপুরের ইস্কন মন্দির। এর পর গত ৫ জুলাই সকলের জন্য মন্দির খুলে দেওয়া হলেও কঠোর বিধিনিষেধ ছিল। কিন্তু সে বার মাত্র পঁয়ত্রিশ দিনের মাথায় ফের মন্দির বন্ধের সিদ্ধান্ত নিতে বাধ্য হন মন্দির কর্তৃপক্ষ।