প্রধানমন্ত্রী শেখ হাসিনার বিশেষ উন্নয়ন প্রকল্পে অনিয়মের অভিযোগ সংক্রান্ত বিশ্ববিদ্যালয় মঞ্জুরি কমিশনের (ইউজিসির) প্রতিবেদনে মিথ্যা তথ্য প্রকাশ করা হয়েছে বলে অভিযোগ করেছেন বেগম রোকেয়া বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য। এ জন্য তিনি শিক্ষামন্ত্রীর ওপর ক্ষোভ প্রকাশ করেন।

বিশ্ববিদ্যালয়ের সাবেক উপাচার্য ড. এ কে এম নূর উন নবীর আমলে বিশেষ প্রকল্প নেয়া হয়েছে জানিয়ে বর্তমান উপাচার্য ড. নাজমুল আহসান কলিমুল্লাহ প্রকল্পে অনিয়মের জন্য তাদের দায়ী করেন। এসময় তিনি বর্তমান শিক্ষামন্ত্রী ডা. দীপু মনির ওপর ক্ষোভ প্রকাশ করেছেন।