আইন ও প্রথা অনুযায়ী বিশ্ববিদ্যালয়ে উপাচার্যের পদ শূন্য হলে সহ–উপাচার্যকে রুটিন দায়িত্বে বা ভারপ্রাপ্ত উপাচার্য করা হয়। সহ–উপাচার্য না থাকলে সেই দায়িত্ব পান কোষাধ্যক্ষ। যদি কোষাধ্যক্ষও না থাকে, তাহলে ডিন বা জ্যেষ্ঠ শিক্ষককে এ দায়িত্ব দেওয়া হয়। কিন্তু শেরেবাংলা কৃষি বিশ্ববিদ্যালয়ে কোনোটিই মানা হয়নি। ‘নজিরবিহীনভাবে’ বিশ্ববিদ্যালয়ের রেজিস্ট্রারকে উপাচার্যের রুটিন দায়িত্ব দিয়েছে সরকার।